Câu chuyện xảy ra sau khi trận đấu cuối cùng của giải vô địch Pokemon thế giới giữa Satoshi và Dande một nhà huấn luyện mạnh nhất thế giới, sau trận đấu đó Satoshi lại đột nhiên biến mất khỏi giới Pokemon được 7 năm hiện chưa rõ tung tích của cậu ấy . Tại một trường học ở vùng SANDS , một cô tiểu thư có mái tóc mật ong rất nổi tiếng đã đánh bại Eru được mệnh danh là nữ hoàng Kalos và hiện giờ cô đang học tại ngôi trường ấy với những người bạn như Hikari , Koharu... . Liệu chuyện gì sẽ xảy ra với họ cũng như tung tích của chàng thiếu niên kia ?