Galaxy in Flames kể về sự kiện "Sự tàn bạo trên Istvaan III", nước đi đầu tiên của Sự Dị giáo của Horus được diễn ra. Đó là vụ đánh bom virus lên Istvaan III và sự điên loạn cuối cùng của Warmaster Horus, dẫn đến một cuộc nội chiến tàn khốc nơi các anh em sẽ giết hại lẫn nhau anh em. Trong vùng đất hoang chứa đầy virus chết chóc và hủy diệt trên Istvaan III, các phần tử Trung thành của các quân đoàn Luna Wolves, World Eaters, Emperor's Children và Death Guard chiến đấu chống lại những kẻ phản bội của trong quân đoàn của mình trong một cuộc tử thủ tuyệt vọng. Những chiến binh trung thành cuối cùng rồi sẽ chết dưới những lưỡi kiếm của những kẻ từng là anh em của họ. Nhưng họ chỉ sẽ chết sau khi đã khiến cho lũ phản bội phải trả giá rất đắt.